Em resumo, a Funai serve como uma espécie de interlocutor entre diversas formas de organização social indígenas e não indígena e assim contribui para a construção de relações interculturais, que considerem ao máximo o modo de vida e os planos de futuro dos povos indígenas.
São princípios de atuação indigenista:
1. Garantia de um dialogo intercultural respeitoso
2. Respeito e fortalecimento da autonomia e formas de organização próprias dos povos indígenas com reconhecimento de suas decisões.
3. Acompanhamento diferenciado para povos indígenas de recente contato e/ou em terras com presença de índios isolados
4. Garantia de informação adequada aos povos indígenas e de acordo com a legislação em vigor
5. Fundamentação das decisões de governo que afetam povos indígenas considerando suas formas próprias de organização e os direitos de participação e de consulta livre prévia e informada
